19 декабря 2012 года Комитет Калининградской областной Думы по бюджету одобрил в двух чтениях поправки в региональный закон «О налоге на имущество организаций», предусматривающие освобождение религиозных организаций от этого налога. 24 декабря областная Дума утвердила законопроект.
17 декабря 2012 года стало известно о начале переезда калининградского цирка-шапито «Янтарь» с улицы Октябрьской в Южный парк для того, чтобы освободить площадку для строительства синагоги. По словам представителей администрации Калининграда, переезд цирка из микрорайона «Остров» в Южный парк профинансирует инвестор, представляющий интересы еврейской общины.
В ночь на 20 августа 2012 года в Балтийске Калининградской области был подожжен кафедральный Свято-Георгиевский морской собор. Прибывшие по вызову пожарные оперативно потушили огонь, пострадала лишь дверь. На стенах храма были обнаружены оскорбительные надписи.
31 июля 2012 года стало известно о ряде случаев гонений на Свидетелей Иеговы: сотрудниками правоохранительных органов было сорваны богослужебное собрание в поселке Мурмаши Мурманской области, в Татарстане, Кировской и Тверской областях Свидетели Иеговы были задержаны во время проповеди, в Карелии в домах Свидетелей Иеговы были проведены обыски.
12 июля 2012 года Калининградский областной суд вынес приговор в отношении 20-летнего жителя Калининграда, попытавшегося взорвать строящуюся в Калининграде мечеть в ноябре 2011 года. Он признан виновным по ст. 30 УК РФ и ст. 205 УК РФ (покушение на совершение террористического акта) и приговорен к трем годам колонии общего режима.