13 октября 2017 года стало известно, что Томской епархии передано в собственность здание бывшего училища связи на улице Никитина. Здание является памятником культурного наследия. На епархию возложены обязательства по выполнению требований законодательства в части сохранения его как памятника.
Здание было построено в 1899 году как духовная семинария с домовым храмом. В советское время здесь располагались объекты Министерства обороны. Несколько лет назад министерство передало его на баланс мэрии Томска. В 2016 году в здании произошел пожар.
Епархия также претендовала на здание бывшего епархиального училища на улице Кирова. В 2016 году мэр Томска предложил использовать это здание сразу двум школам: общеобразовательной и православной гимназии, но пока это предложение не получило развития.