Прокуратура Кабардино-Балкарской республики возбудила уголовное дело в отношении руководителя регионального отделения "Российского исламского наследия" Руслана Нахушева по ч. 4, 5 ст. 33 (соучастие в преступлении) и ст. 205 (подстрекательство к терроризму) УК РФ. Для предварительного рассмотрения дело было передано в Управление ФСБ по КБР.

Данными о местонахождении Р.Нахушева правоохранительные органы по-прежнему не располагают. Один из сотрудников сообщил "Интерфаксу", что "4 ноября Нахушев был вызван в УФСБ для дачи показаний в качестве подозреваемого по данному уголовному делу. Он прибыл в УФСБ, но в связи с тем, что был без адвоката, было решено перенести разговор со следователем на 8 ноября. На этом беседа была закончена, и Нахушев покинул здание УФСБ".

9 ноября появилось сообщение о возбуждении прокуратурой Кабардино-Балкарии уголовного дела по ч. 1 ст. 126 УК РФ (похищение человека) по факту исчезновения Р.Нахушева.

Между тем 16 ноября, выступая в офисе РИА "Новости" на презентации совей новой книги, известная журналистка и писательница Юлия Латынина заявила, что Р. Нахушев сотрудничал с ФСБ. Как передает Портал-Credo.ru, "по словам г-жи Латыниной, Институт исламских исследований был своеобразной зонтичной структурой, с помощью которой и через Руслана Нахушева Лубянка пыталась перевоспитать и одновременно проконтролировать деятельность и связи двух известных в республике радикалов - Анзора Астемирова и Мусы Мухожева. Руслан Нахушев же был направлен на эту работу как профессиональный чекист и арабист".

15 марта 2006 г. ИА REGNUM сообщило, что дело об исчезновении Р. Нахушева находится на контроле Главного управления Генеральной прокуратуры РФ в Южном федеральном округе. Кроме того, контроль за ходом этого расследования осуществляется и администрацией президента КБР.

При этом чуть ранее, 10 марта, Верховный суд республики отказался удовлетворить требование адвокатов правозащитника о признании незаконным постановления прокурора о возбуждении уголовного дела в отношении Р. Нахушева - его по-прежнему обвиняют в подстрекательстве к терроризму.

В июне МВД Кабардино-Балкарии опубликовало "черный список" террористов, куда был включен пропавший Р.Нахушев. Тем временем его адвокат А.Дикинов, получив доступ к материалам следствия, выяснил, что обвинение Нахушева в терроризме построено на публикации в "Российской газете", никаких доказательств противоправной деятельности нет.