16 сентября 2024 года стало известно, что исламовед Роман Силантьев обратился к главе Следственного комитета РФ Александру Бастрыкину с просьбой запретить Духовное управление мусульман РФ и Совет муфтиев России.

Силантьев называет обе организации, которые возглавляет муфтий Равиль Гайнутдин, «наиболее криминализированными религиозными организациями страны».

В частности, утверждает исламовед, представители этих организаций чаще других фигурируют в криминальной хронике, несмотря на то что контролируют не более 9% зарегистрированных и не более 7% реально действующих в стране мусульманских общин. Сам Гайнутдин и его подчиненные высказывались в поддержку «ваххабизма», а также запрещенных в России организаций «Нурджулар», «Хиз бут-Тахрир» и др. Кроме того, по подсчетам Силантьева, 41 представитель ДУМ РФ и Совета муфтиев привлечен к ответственности по экстремистским статьям, что «не только является абсолютным рекордом среди мусульманских организаций, но и значительно превышает количество духовных лидеров всех религиозных направлений России».

«Как судебный эксперт, работающий в том числе по запросам Следственного комитета России, могу заметить, что самым распространенным подходом к признанию организаций или движений экстремистскими является анализ деятельности их адептов. Если адепты регулярно осуждаются за разжигание розни, оправдание и финансирование терроризма, а также за более тяжкие преступления, то это является главным аргументом для запрета всей организации. Полагаю, что массовое участие не просто рядовых членов Совета муфтиев — ДУМ РФ, а духовных лидеров уровнем до муфтия в преступлениях экстремистского и террористического характера является достаточным основанием для признания этих централизованных организаций экстремистскими», — говорится в обращении Силантьева.