Воронежской общине христиан веры евангельской предъявлено устное обвинение в нарушении градостроительного законодательства. В начале 2002 года община выиграла конкурс на участок в промзоне Воронежа, причем других претендентов на участок в момент проведения конкурса не было. Все религиозные организации, кроме Воронежской епархии русской православной церкви, согласно требованию городской администрации должны были участвовать в открытом конкурсе наравне с коммерческими организациями. При этом мэрия ссылалась на указ президента Ельцина 1998 года. Воронежский адвокат Станислав Рывкин полагает, что это вольная трактовка закона, а кроме того, с тех пор сильно изменилось федеральное законодательство.
За 2002 год руководители общины полностью оформили документы на участок, строительство молитвенного дома должно было начаться весной 2003 года. Однако в архитектурном управлении Воронежа выдачу технического паспорта на участок стали задерживать, главный архитектор мотивировал это тем, что представители общины нарушили закон, и несмотря на наличие документов, проект молитвенного дома подписан не будет. Нарушение же, по его словам, заключается в том, что на заявке перед подачей документов на конкурс, не было подписи территориального комитета общественного самоуправления. Между тем, жильцы соседних домов (ближайший из которых находится в 500 м от предполагаемого места строительства) высказывают возмущение тем, что "сектанты уничтожают единственную в округе лужайку".
Пастор Андрей Башмаков напомнил главному архитектору, что организаторы конкурса сами занимались оформление документов, посему отсутствие подписи - не вина общины, а кроме того, для управления юстиции не отсутствие этой подписи не стало поводом для отказа в праве на аренду. В самом же комитете общественного самоуправления утверждают, что у них нет претензий к общине, участок они никогда не считали "своим", а возмущение жильцов было "организовано" ректором Воронежской духовной семинарии Василием Поповым. Кроме того, пастор напомнил, что председатель комитета мэрии Воронежа поземельным отношениям и недвижимости в настоящее время ожидает суда по обвинению в получении взятки от потенциального участника конкурса.
При этом, по словам Андрея Башмакова, община не намерена пока обращаться в суд и объявила неделю молитвы и поста.

16 июня 2004 г. Портал-Credo.ru сообщил, что от имени недовольных строительством молитвенного дома жителей окрестных домов подан судебный иск. Суд должен установить, было ли законным решение властей о выделении земли пятидесятникам. За это время верующие успели оформить аренду участка на 49 лет и утвердить эскиз плана молитвенного дома на 500 мест. До судебного решения строительных работ на участке вестись не будет.

22 ноября стало известно, что Федеральным судом Левобережного района Воронежа по представлению районной прокуратуры было возбуждено гражданское дело о незаконном выделении земельного участка "Центру духовного служения" пятидесятников. Основанием для возбуждения дела послужили именно обращения возмущенных горожан.

Портал-Credo.ru со ссылкой на юриста Марину Митюрёву, которая представляет интересы пятидесятников, сообщает, "что противники строительства из числа жителей микрорайона, - как показали несколько встреч, - не имеет ни малейших представлений ни о "Центре духовного служения", ни о пятидесятничестве как религиозном направлении в протестантизме; "они твердят одно и то же - "иеговистам строить не дадим!" Кроме этого, население продемонстрировало отсутствие готовности к какому-либо диалогу: несмотря на то, что прошедшее предварительное выездное судебное слушание непосредственно на месте предполагаемого строительства не выявило никаких признаков вырубки деревьев будущим застройщиком ("Центром духовного служения"), люди утверждали судье, что такие действия в парковой зоне осуществлялись. Вместе с тем, у парковой зоны нет документально признанных границ, что подтверждает представленная суду справка".

15 декабря состоялось второе по счету Левобережного суда Воронежа по иску районной прокуратуры к администрации Воронежа и "Центру духовного служения". По словам М.Митюревой, суд не приобщил к материалам дела 726 подписей близлежащих домов, согласных со строительством на данном участке духовно-административного центра пятидесятников. Судья мотивировала свое решение тем, что подписи подтверждают позицию только одной стороны конфликта. М.Митюрева сообщила, что подписи собирались строго в соответствии со стандартами, содержащимися в положении об опросе граждан по проблемам градостроительной политики, которое было принято Городской думой Воронежа в 2004 году.
Также суд отказался приобщить к делу видеозапись новостного сюжета местного телеканала, по мнению пятидесятников, создающий негативный образ религиозной организации.

Судья сообщила, что, поскольку практики решения таких конфликтов нет, не исключено, что понадобится местный референдум, но в этом случае возникает вопрос о финансировании плебисцита.