В середине декабря 2013 года стало известно, что в Санкт-Петербурге рассматривается дело о ликвидации Центра православного просвещения. Иск о ликвидации организации городская прокуратура подала еще 16 сентября 2013 года. Прокуратура считает, что Центр занимается незаконной религиозной деятельностью, тогда как в уставе заявлена только просветительская. Как нарушение устава прокуратура расценила тот факт, что в принадлежащих Центру помещениях располагаются приходы Российской православной автономной церкви (РПАЦ).
19 июля 2013 года в Санкт-Петербурге были задержаны десятки мусульман. После пятничной молитвы в исламских центрах на Васильевском острове (на 4-ой и 6-ой линиях, на ул. Беринга) сотрудники полиции и ФСБ проверяли документы у прихожан мечетей.