В ходе встречи с руководителями Северной Осетии председатель Совета муфтиев России Равиль Гайнутдин посетовал на то, что на месте бесланской трагедии есть только православный символ, и предложил построить на месте разрушенной школы мемориальный комплекс, который бы не был разделен по религиозному признаку. Это заявление было воспринято в Русской православной церкви как высказывание против строительства православного храма в Беслане.
Союз православных граждан
обвинил главу СМР в спекуляции на трагедии и в разжигании межконфессиональной розни.
Между тем 27 марта, выступая в ростовском пресс-центре агентства "Интерфакс-Юг", Р. Гайнутдин
вновь заявил, что в Беслане кроме православного храма необходимо построить и мечеть.
25 апреля, встречаясь с родственниками погибших, Р.Гайнутдин заявил, что на месте школы не должно быть ни мечети, ни храма, а нужен "нейтральный, не имеющий никакой религиозной символики" мемориал. Его поддержали участники встречи.
По сообщению
Ислам.Ру от 27 апреля, на встрече с представителями организации матерей Беслана управделами Московской патриархии РПЦ митрополит Калужский и Боровский Климент "отметил, что не поддерживает идею строительства церкви на месте городской школы N 1, где погибли сотни бесланских детей, так как это может внести раскол в общество".