В отношении Александра Гончаренко в 2023 году было возбуждено уголовное дело о повторной дискредитации армии.

В марте 2024 года стало известно, что еще 28 ноября 2023 года Октябрьский районный суд Барнаула заочно арестовал бывшего председателя республиканского отделения партии «Яблоко» Александра Гончаренко по ч. 1 ст. 280.3 УК (повторная дискредитация использования вооруженных сил России). 28 декабря Алтайский краевой суд утвердил это решение.

Гончаренко покинул Россию в ноябре 2022 года. До этого, 11 апреля 2022 года суд оштрафовал его на 30 тысяч рублей по административной статье о дискредитации армии (ч. 1 ст. 20.3.3 КоАП) за пост под названием «Не хочу и не могу молчать», который был опубликован 2 марта того же года на сайте «Яблока». С чем связано его уголовное преследование, неизвестно.